He estado investigando y he descubierto varias posible razones por las que este plugin deja de funcionar en Ubuntu Jaunty Jackalope 9.04 y la forma de solucionarlas. He de decir que a mí me ha funcionado una de ellas y que en la actualidad me funciona el plugin a la perfección, sin necesidad de hacer una reinstalación desde cero de la nueva versión de Ubuntu.
Aquí está la lista de causas/soluciones al problema Flash Player en Ubuntu 9.04:
Solución 1
Abrir una terminal de comandos y borrar el plugin Flash actualmente instalado
sudo apt-get remove flashplugin-* --purge
Instalar de nuevo el plugin Flash
sudo apt-get install flashplugin-nonfree
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Solución 2 (La que a mí me ha funcionado)
Si tenéis instalado algun otro plugin (gnash ó swfdec), deberéis desinstalarlo, ya que al parecer tienen incopatibilidades con el plugin Flash Player
Así que desinstalamos los plugins que dan problemas de compatibilidad
sudo apt-get remove --purge swfdec-mozilla swfdec-gnome mozilla-plugin-gnash gnash
Instalamos el plugin Flash Player
sudo apt-get install flashplugin-nonfree
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Solución 3
El mal funcionamiento del plugin Flash Player podría deberse a una incompatibilidad con una de las opciones de Compiz, así que para que funcione correctamente el plugin, hay que modificar esa opción en Compiz.
Primero instalamos el Gestor de configuración de Compiz
sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
Luego vamos al menú Systema > Preferencias > Administrador de Opciones CompizConfig y en la ventana de configuración que nos sale, pinchamos en el icono «General» y luego en el icono «Opciones Generales». Una vez en la pantalla de configuración de «Opciones Generales», hay que desmarcar la opción «Anular redirección de ventanas a pantalla completa»
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Solución 4
Bajarse la última versión disponible del plugin Flash Player de la página web de Adobe.
Extraer el contenido del archivo comprimido con la siguiente orden
tar -xzvf libflashplayer-10.0.32.18.linux-x86_64.so.tar.gz
Mover el archivo anteriormente extraído (libflashplayer.so) a la ubicación /usr/lib/mozilla/plugins
sudo mv libflashplayer.so /usr/lib/mozilla/plugins/libflashplayer.so
Espero que alguna de las opciones aquí indicadas os sirva para que vuestro Flash Player funcione correctamente en Ubuntu 9.04.